Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPA33Q99795 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms