Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX18Q96RF0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms