Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms