Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA3Q96EY1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA3Q96EY1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms