Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms