Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP4CQ96CF2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms