Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms