Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PHIPQ8WWQ0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHIPQ8WWQ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHIPQ8WWQ0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHIPQ8WWQ0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms