Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C15orf40Q8WUR7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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