Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms