Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms