Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms