Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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