Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTE2Q6XPS3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms