Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL4Q6XD76 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms