Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3EQ6PEY2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms