Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6P435 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6P435 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6P435 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms