Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC4Q6P2E9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms