Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM29Q5VYK3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms