Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms