Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CC2D1BQ5T0F9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms