Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms