Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A12Q504Y0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A12Q504Y0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms