Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms