Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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