Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B3Q16720 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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