Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKN2Q16513 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms