Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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