Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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LAPTM4AQ15012 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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LAPTM4AQ15012 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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LAPTM4AQ15012 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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