Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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