Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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