Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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