Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATMQ13315 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ATMQ13315 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATMQ13315 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMQ13315 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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