Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RESTQ13127 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RESTQ13127 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RESTQ13127 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RESTQ13127 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RESTQ13127 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RESTQ13127 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RESTQ13127 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RESTQ13127 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RESTQ13127 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RESTQ13127 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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