Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms