Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms