Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC18A2Q05940 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms