Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CREMQ03060 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CREMQ03060 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CREMQ03060 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CREMQ03060 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREMQ03060 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREMQ03060 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREMQ03060 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREMQ03060 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms