Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms