Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDR2Q01850 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDR2Q01850 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDR2Q01850 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDR2Q01850 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms