Protein–RNA interactions for Protein: Q00325

SLC25A3, Phosphate carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3Q00325 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A3Q00325 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC25A3Q00325 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms