Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRB1P82279 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRB1P82279 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRB1P82279 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRB1P82279 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms