Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HBBP68871 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HBBP68871 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HBBP68871 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HBBP68871 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HBBP68871 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HBBP68871 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms