Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFM1P61960 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFM1P61960 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms