Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VBP1P61758 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms