Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms