Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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