Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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