Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms