Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LUMP51884 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LUMP51884 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LUMP51884 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LUMP51884 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LUMP51884 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LUMP51884 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LUMP51884 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LUMP51884 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LUMP51884 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms